Stacja Hydrobiologiczna w Mikołajkach, położona w Krainie Wielkich Jezior Mazurskich, jest bazą naukową do badań terenowych i częścią Stacji Badawczej Instytutu Nenckiego Polskiej Akademii Nauk.
Posiada bezpośredni dostęp do Jeziora Mikołajskiego oraz szereg laboratoriów z akwariami wykorzystywanymi do eksperymentów hydrobiologicznych. Stacja koncentruje się na badaniu organizmów wodnych, w tym ryb, bezkręgowców, planktonu i glonów, a także ich interakcji ze środowiskiem. Oprócz badań nad organizmami wodnymi, stacja prowadzi również badania nad ekologią lądową, jak na przykład eksperyment przeprowadzony w latach 60. w celu zasiedlenia okolicznych wysp gryzoniami. Stacja jest wyposażona w nowoczesne technologie i urządzenia, w tym automatyczną stację meteorologiczną, stację monitorowania jakości wody oraz laboratorium do analiz genetycznych. W stacji odbywają się również różne zajęcia edukacyjne, takie jak wykłady, warsztaty i wycieczki terenowe.
Jest ważnym ośrodkiem badawczym zajmującym się ekologią wodną i lądową w regionie Wielkich Jezior Mazurskich.